El Centro de Inversiones de la FAO coordina y guía la asociación cada vez mayor de la FAO con el GAFSP, que comenzó con la creación de este en 2010. La FAO desempeña la doble función de ejecutora y supervisora. Si bien los países son responsables de la puesta en marcha de proyectos, el Centro actúa como punto focal para la FAO. Garantiza una coordinación eficaz entre las diversas partes interesadas y al mismo tiempo brinda orientación estratégica y control de calidad en documentos, propuestas e informes del proyecto presentados al GAFSP.

El Centro ha apoyado proyectos en Bangladesh y Senegal, parte de la iniciativa Missing Middle del GAFSP (que podría traducirse como Eslabón Perdido), un exitoso proyecto piloto que arrancó en 2021. A partir de esta experiencia, el GAFSP introdujo una nueva vía de financiación que ofrece pequeñas subvenciones a las organizaciones de productores para que accedan a tecnología, financiación y mercados.

A finales de 2023 la cartera de la FAO/GAFSP alcanzaba un total de 22 proyectos, en su mayor parte en África y Asia, y un proyecto en América Latina (por valor de más de 60 millones de USD). Esto contabiliza proyectos en preparación y ejecución, así como proyectos ya cerrados.

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